Контролем за ведением охотничьего хозяйства на территории России с 1990 г. вместо Главохоты при Совмине РФ стал заниматься вновь созданный Охотдепартамент в составе Минсельхоза РФ. В 2004 г. он был разделен и вошел в состав Федерального агентства по сельскому хозяйству (в настоящее время ликвидирован) и Федеральную службу по ветеринарному и фитосанитарному надзору Минсельхоза РФ (Россельхознадзор), сюда же временно входило Федеральное агентство по рыболовству.
На Федеральное агентство по сельскому хозяйству были возложены следующие обязанности: самостоятельно осуществлять правовое регулирование, ведение охоты и охотничьего хозяйства, мониторинга по объектам охоты, воспроизводство, акклиматизация, разведение, использование ресурсов охотничьих животных и др. На Федеральную службу по ветфитосанитарному надзору возложены функции по контролю и надзору за охраной, воспроизводством, использованием объектов охоты, водных биологических ресурсов, выдаче различных разрешений (лицензий). На областном и районном уровнях были произведены соответствующие преобразования.
В настоящее время на правительственном уровне решен вопрос о передаче всех полномочий на ведение охотничьего хозяйства в России из Министерства сельского хозяйства РФ в Министерство природных ресурсов РФ, а контрольные функции – из Россельхознадзора в Росприроднадзор.
Таким образом, охотничье хозяйство на сегодняшнем этапе характеризуется отсутствием четкой государственной политики и полным упадком.
История организованного охотничьего движения в России насчитывает почти полторы сотни лет, но цели и задачи разведения охотничьих и промысловых животных, сохранения среды их обитания и правильной охоты, стоявшие перед охотничьей общественностью еще в XIX веке, перешли в ХХ век, остаются актуальными в XXI веке и требуют своего решения.