Задача поднять два корпуса командованию транспортной флотилии ставилась, однако в полной мере решена так и не была. Причина этого заключалась в том, что значительная часть судов (к началу апреля 1916 г. — 45 единиц, то есть почти половина флотилии) постоянно отвлекалась для решения иных задач — грузовых перевозок в интересах войск Юго-Западного и Румынского фронтов, снабжения группировки войск Кавказской армии в Восточной Анатолии, транспортировки хозяйственных грузов и т. п.